Petr Pečinka

Basic information

CV

Publications

Teaching

Supervised theses

Projects

Academic degree, name, surname:	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Room, floor, building:	L 204, Building L
Position:
Research interests and teaching:
Department/ Faculty:	Department of Biology and Ecology (Faculty of Science) Environmental Center
Phone number, mobile:	+420 553 46 2318
E-mail:
Personal website:

No record found.

All publications

Bartas, M., Brázda, V., Karlický, V., Červeň, J. a Pečinka, P. Bioinformatics analyses and in vitro evidence for five and six stacked G-quadruplex forming sequences. BIOCHIMIE. 2018, 150(July), s. 70-75. ISSN 0300-9084.

Bartas, M., Červeň, J., Oppelt, J., Peteja, M., Vávra, P., Zonča, P., Procházka, V., Brázda, V. a Pečinka, P. Liver regeneration during the associating liver partition and portal vein ligation for staged hepatectomy procedure in Sus scrofa is positively modulated by stem cells. Oncology letters. 2018, č. 15, s. 6309-6321. ISSN 1792-1074.

Červeň, J., Mikysková, N., Niziolová, A., Bartas, M., Brázda, V. a Pečinka, P. Preferential binding of p53 and BRCA1 proteins to naturally occurring G-quadruplexes forming sequences. In: The 43rd FEBS Congress Pague. Praha. 2018.

Bartas, M., Mikysková, N., Brázda, V., Karlický, V., Červeň, J., Špunda, V. a Pečinka, P. Six-stacked G-quadruplexes as a preferential target of p53. In: The 43rd FEBS Congress Prague. Praha. 2018.

Brázda, V., Červeň, J., Bartas, M., Mikysková, N., Coufal, J. a Pečinka, P. The Amino Acid Composition of Quadruplex Binding Proteins Reveals a Shared Motif and Predicts New Potential Quadruplex Interactors. Molecules. 2018, 23(9), ISSN 1420-3049.

Bartas, M., Brázda, V., Červeň, J., Karlický, V., Špunda, V. a Pečinka, P. Bioinformatic study of putative five and six stacked G-quadruplexes occurence in Homo sapiens genome. In: Genetic Toxicology and Cancer Prevention 2017 Smolenice. Bratislava: Cancer Research Institude, 2017. s. 62-66. ISBN 978-80-972247-2-1.

Červeň, J., Rybková, Z., Sezimová, H., Pečinka, P. a Malachová, K. Antimutagenic and DNA Damage Protective Activities of a Grape Extract from Vitis vinifera. In: The 5th Genetics and Genomics Conference. Nanjing. 2016.

Rybková, Z., Malachová, K., Červeň, J., Sezimová, H. a Pečinka, P. Antimutagenic and DNA Damage Protective Activities of a Grape Extract from Vitis vinifera. Journal of Biosciences and Medicines. 2016, č. 4, s. 1-8. ISSN 2327-5081.

Červeň, J., Rybková, Z., Sezimová, H., Malachová, K., Pečinka, P. a Ji, R. Isolation of bacterial and fungal BPA and TBBPA degraders from polluted soils. In: 2nd International conference on environmental pollution and health. Guangzhou. 2016.

Červeň, J., Havran, L., Pečinka, P. a Fojta, M. Electrochemical Activity of Wedelolactone and Probing its Interaction with DNA Using Voltammetry at a Carbon Electrode. ELECTROANAL. 2015, č. 27, s. 2268-2271. ISSN 1040-0397.

Adámik, M., Bažantová, P., Navrátilová, L., Polášková, A., Pečinka, P., Holanová, L., Tichý, V. a Brázdová, M. Impact of cadmium, cobalt and nickel on sequence-specific DNA binding of p63 and p73 in vitro and in cells. BIOCHEM BIOPH RES CO. 2015, č. 456, s. 29-34. ISSN 0006-291X.

Bažantová, P., Červeň, J., Pečinka, P., Adámik, M., Tichý, V. a Brázdová, M. Effect of transition metals on sequencespecific binding of p53 family proteins. s. 459-459.

Červeň, J., Pečinka, P. a Bažantová, P. Electrochemical approach for detection of p53-DNA interactions. s. 123-123.

Pečinka, P., Červeň, J. a Bažantová, P. Kontaminace prostředí a změny na molekulárně genetické úrovni. In: Studium dopadů průmyslových technologií na životní prostředí. 1. vyd. ostrava: Ostravská univerzita v Ostravě, 2014. s. 65-85. ISBN 978-80-7464-644-7.

Bažantová, P., Červeň, J., Dolný, A., Drozd, P., Ďuriš, Z., Horká, I., Kalina, J., Karlický, V., Kočárek, P., Kukutschová, J., Malachová, K., Maršálek, R., Materová, Z., Mucha, M., Navrátil, M., Navrátilová, Z., Nezval, J., Novotný, Č., Opálková, M. a Pečinka, P. et al. Studium dopadů průmyslových technologií na životní prostředí. 1. vyd. Ostrava: Ostravská univerzita v Ostravě, 2014. 208 s. ISBN 978-80-7464-644-7.

Červeň, J., Pečinka, P., Bažantová, P., Fojta, M., Malachová, K. a Sezimová, H. Využití elektrochemických metod pro studium DNA-protein interakcí. In: Využití elektrochemických metod pro studium DNA-protein interakcí.

Červeň, J., Pečinka, P., Bažantová, P., Chvátalová, B. a Brázdová, M. EMSA detection of p53 sequence non-specific binding in PCR produced human DNA analogues. J BIOMOL STRUCT DYN. 2013, č. 31, s. 40-40. ISSN 0739-1102.

Pečinka, P., Brázdová, M., Navrátilová, L., Tichý, V., Němcová, K., Lexa, M., Hrstka, R., Adámik, M., Vojtěšek, B., Palaček, E., Deppert, W. a Fojta, M. Preferential Binding of Hot Spot Mutant p53 Proteins to Supercoiled DNA In Vitro and in Cells. PLOS one. 2013, č. 8, s. 1-17. ISSN 1932-6203.

Pečinka, P., Bažantová, P., Červeň, J., Malachová, K. a Brázdová, M. Investigation of sequence specific interaction of p63 and mutant p35-p63 interaction in vitro and in vivo. In: Investigation of sequence specific interaction of p63 and mutant p35-p63 interaction in vitro and in vivo. EMBO, 2012. s. 62-62.

Pečinka, P., Pivoňková, H., Šebest, P., Tichá, O., Němcová, K., Brázdová, M., Brázdová-Jagelská, E., Brázda, V. a Fojta, M. Selective binding of tumor suppressor p53 protein to topologically constrained DNA: Modulation by intercalative drugs. BIOCHEM BIOPH RES CO. 2010, č. 393, s. 894-899. ISSN 0006-291X.

Pečinka, P., Pavlíčková, Z. a Červeň, J. Detection of genotoxicity by the means of DNA repair enzymes. In: Environmental changes and biological assessment IV. 1. vyd. University of Ostrava, 2008. s. 17-20. ISBN 978-80-7368-451-8.

Brázdová-Jagelská, E., Brázda, V., Pečinka, P., Paleček, E. a Fojta, M. DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites.. BIOCHEM J. 2008, č. 412, s. 57-63. ISSN 0264-6021.

Pavlíčková, Z., Pečinka, P. a Červeň, J. Oxidative damage of DNA induced in plasmid by the reactions with chemical agents. In: Environmental changes and biological assessment IV. 1. vyd. Ostrava: University of Ostrava, 2008. s. 85-89. ISBN 978-80-7368-451-8.

Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Detection of genotoxicity of environmental contaminants using bacterial mutagenicity tests and by means of plasmid DNA. Faculty of Biology, University of Freiburg. 2007.

Pavlíčková, Z., Červeň, J., Malachová, K. a Pečinka, P. Detection of genotoxicity of chemical compounds using direct cleavage of sugar-phosphate backbone in supercoiled plasmid DNA. Chemické zvesti. 2007, roč. 3, s. 217-217. ISSN 1336-7242.

Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Inovace výběrových cvičení z mikrobiologie. 2007.

Pečinka, P. Laboratorní cvičení z molekulární biologie. 2007.

Malachová, K. a Pečinka, P. Obecná biologie. 2007.

Pivoňková, H., Tichá, O., Fojta, M. a Pečinka, P. Recognition of negatively or positively supercoiled DNA topoisomers by the p53 protein.. FEBS J. 2007, č. 274, s. 153-153. ISSN 1742-464X.

Červeň, J., Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Usage of DNA repair enzymes for detection of DNA base damage induced by mutagenic and genotoxic compounds. In: 59. Zjazd chemikov. Tatranské Matliare. 2007.

Červeň, J., Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Usage of DNA repair enzymes for detection of DNA base damage induced by mutagenic and genotoxic compounds. Chemické zvesti. 2007, roč. 3, s. 136-136. ISSN 1336-7242.

Pečinka, P., Malachová, K. a Pavlíčková, Z. Vybudování laboratoře molekulární biologie na Katedře biologie a ekologie Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity v Ostravě. 2007.

Fojta, M., Brázdilová, P., Cahová, K. a Pečinka, P. A single-surface electrochemical biosensor for the detection of DNA triplet repeat expansion.. ELECTROANALSIS. 2006, č. 18, s. 141-151. ISSN 1040-0397.

Pivoňková, H., Pečinka, P., Češková, P. a Fojta, M. DNA modification with cisplatin affects sequence-specific DNA binding of p53 and p73 in the target site-dependent manner. FEBS Journal. 2006, č. 273, s. 4693-4706. ISSN 1742-464X.

Malachová, K., Pečinka, P., Kočárek, P. a Majkus, Z. Nové trendy v biologických oborech. 2006.

Fojta, M., Brázdilová, P., Pečinka, P., Cahová, K. a Fojtová, M. Optimalizace postupů elektrochemické detekce amplifikovaných úseků genomové DNA s využitím molekulární hybridizace. In: Sborník přednášek . s. 23-25.

Pivoňková, H., Pečinka, P., Češková, P. a Fojta, M. Ovlivnění interakce proteinů p53 a p73 s cílovými sekvencemi modifikací DNA cisplatinou. In: Sborník příspěvků . s. 14-14.

Brázdová-Jagelská, E., Brázda, V., Pečinka, P. a Paleček, E. Sequence specific DNA binding of p53 can be enhanced by DNA supercoiling. In: Abstracts. s. 270-. ISBN 80-969532-6-5.

Fojtová, M., Brázdilová, P., Pečinka, P., Cahová, K., Havran, L. a Fojta, M. Využití elektrochemických metod při analýze genové exprese. In: Sborník přednášek. s. 26-29.

Pavlíčková, Z., Malachová, K. a Pečinka, P. Zkvalitnění a inovace výuky Cvičení z molekulární biologie. 2006.

Brázda, V., Jagelská, E., Karlovská, L., Pečinka, P., Pospíšilová, Š., Vojtěšek, B. a Paleček, E. Male infanticide in captive plains zebra (Equus burchelli).. Animal Behaviour. 2005, roč. 59, s. 689-694.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P. a Paleček, E. Regulation of the DNA-binding ability of P53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies.. FEBS J. 2005, č. 272, s. 302-302. ISSN 1742-464X.

Paleček, E., Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P., Karlovská, L. a Brázdová, M. Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling. ONCOGENE. 2004, č. 23, s. 2119-2127. ISSN 0950-9232.

Paleček, E., Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P., Karlovská, L. a Brázdová, M. Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling.. ONCOGENE. 2004, roč. 23, č. 23, s. 2119-2127. ISSN 0950-9232.

Jagelská, E., Brázda, V., Pečinka, P., Karlovská, L. a Paleček, E. Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercolling. In: Poster Abstracts. s. 95a-.

Jelen, F., Kouřilová, A., Pečinka, P. a Paleček, E. Microanalysis of DNA by stripping transfer voltammetry.. BIOELECTROCHEMISTRY. 2004, č. 63, s. 249-252. ISSN 1567-5394.

Jagelská, E., Brázda, V., Pečinka, P., Pospíšilová, Š. a Paleček, E. New ELISA technique for analysis of p53 protein/DNA binding properties. In: Sborník příspěvků. s. 26-.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P. a Paleček, E. Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies. In: Mol. Cell. Proteomics, 3 (Suppl.). s. S19-.

Brázda, V., Pospíšilová, Š., Jagelská, E., Pečinka, P., Vojtěšek, B. a Paleček, E. Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by protein-kinase C, casein kinase II, cyclin dependent kinase and by monoclonal antibodies. In: Program & Abstracts. s. 130-.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P., Karlovská, L. a Paleček, E. Aktivace vazby nádorového supresoru proteinu p53 k cílovým sekvencím superhelikální DNA. In: Program a souhrny sdělení. s. 10-.

Brázda, V., Jagelská, E., Karlovská, L., Pečinka, P. a Paleček, E. Analysis of p53 protein-DNA binding properties. In: Oral Presentations - Abstracts. s. 5-.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P., Karlovská, L. a Paleček, E. Analysis of tumour suppressor p53 protein binding properties by new ELISA technique. In: Mol. Cell. Proteomics, 2. s. 965-.

Fojta, M., Brázda, V., Pivoňková, H., Brázdová, M., Pečinka, P., Paleček, E. a Paleček, J. Binding of tumor suppressor protein p53 to supercoiled and chemically modified DNA. In: Final programme and Abstrakt book. s. PD3/151-.

Jelen, F., Kizek, R., Pečinka, P. a Paleček, E. Microanalysis of DNA by stripping transfer voltammetry. In: Book of Abstracts. s. 253-.

Fojta, M., Pivoňková, H., Brázdová, M., Pečinka, P., Brázda, V. a Paleček, E. Rozpoznání struktury DNA nádorově supresorovým proteinem p53. Úloha jeho C-terminální domény. In: Sborník příspěvků. s. 6-7.

Brázda, V., Jagelská, E., Karlovská, L., Pečinka, P., Pospíšilová, Š., Vojtěšek, B. a Paleček, E. Analysis of p53 protein-DNA binding properties by new ELISA technique, activation of p53-DNA binding. In: FEBS J.. s. 29-.

Brázda, V., Jagelská, E., Karlovská, L., Pečinka, P. a Paleček, E. Regulation of p53 binding to natural binding elements in supercoiled DNAs by monoclonal antibodies. In: Abstracts.

Brázdová, M., Paleček, J., Cherny, D., Billová, S., Pečinka, P., Vojtěšek, B., Jovin, T. M., Paleček, E. a Fojta, M. Role of tumor suppressor p53 domains in supercoil-selective binding to DNA and p53-DNA filament formation. In: Abstracts.

Brázdová, M., Paleček, J., Cherny, D., Billová, S., Fojta, M., Pečinka, P., Vojtěšek, B., Jovin, T. M. a Paleček, E. Role of tumor suppressor p53domains in selective binding to supercoiled DNA.. Nucleic Acids Research. 2002, roč. 30, s. 4966-4974.

Brázdová, M., Paleček, J., Cherny, D., Billová, S., Pečinka, P., Vojtěšek, B., Jovin, T. M., Paleček, E. a Fojta, M. Role proteinových domén nádorového supresoru p53 při selektivní vazbě na superhelikální DNA a při tvorbě DNA-proteinových filament. In: Sborník příspěvků. s. 21-.

Fojta, M., Brázdová, M., Černocká, H., Pečinka, P., Brázda, V., Paleček, J., Jagelská, E., Vojtěšek, B., Pospíšilová, Š., Subramaniam, V., Jovin, T. M. a Paleček, E. Effects of Oxidation Agents and Metal Ions on Binding of p53 to Supercoiled DNA.. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics . 2000, s. 177-184.

Simonsson, T., Pečinka, P. a Kubista, M. DNA tetraplex formation in the control region of c-myc.. Nucleic Acids Research . 1998, roč. 26, s. 1167-1172.

Pečinka, P. studijní pobyt. 1996.

Paleček, E., Fojta, M., Jelen, F. a Pečinka, P. . Chemical and electrochemical probing of local DNA structures and the role of DNA structures in cancer and genetic diseases. Physics, Chem. and applications of molecular systems Brno. 1995, s. 7-14.

Paleček, E. a Pečinka, P. Chemical Probing of DNA Structure in Cells: Osmium Tetroxide, 2,2´-Bipyridine.. In: EMBO Practical Course on DNA Probing by Metal Complexes. . s. 40-49.

Pečinka, P., Huertas, D., Azorin, F. a Paleček, E. Intramolecular TAT triplex in (dA)58.(dT)58. Influence of ions.. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics . 1995, roč. 13, s. 29-46.

Paleček, E., Pečinka, P., Vojtíšková, M., Řičicová, J. a Boublíková, P. Probing of DNA structure with osmium tetroxide complexes.. Collection Czech. Chem. Commun.. 1993, roč. 58, s. 227-230.

Paleček, E., Jelen, F., Nejedlý, K., Paleček, J., Pečinka, P., Řičicová, J., Vojtíšková, M. a Zachová, D. Osmium tetroxide complexes: single-strand selective probes of the DNA structure in vitro and in cells.. In: Lilley, D. M. J., Heumann, H., and Suck, D. (eds.), Structural Tools for the Analysis of Protein-Nucleic Acid Complexes. Basel: Birghauser Verlag, 1992. s. 1-22. Series Advances in Life Sciences.

Pečinka, P. výzkumný pobyt. 1992.

Jelen, F., Karlovský, P., Makaturová, E., Pečinka, P. a Paleček, E. Osmium tetroxide reactivity of DNA bases in nucleotide sequencing and probing of DNA structure.. General Physiology and Biophysics . 1991, roč. 10, s. 461-473.

Paleček, E., Boublíková, P., Jelen, F., Krejčová, A., Makaturová, E., Nejedlý, K., Pečinka, P. a Vojtíšková, M. Chemical proabing of the DNA polymorphic structure in vitro and in situ. . In: In Sarma, M. H., and Sarma, M. H. (eds.), Structure and Methods. Vol. 3. Schenectady: Adenine Press, 1990. s. 237-253.

Karlovský, P., Pečinka, P., Vojtíšková, M., Makaturová, E. a Paleček, E. Protonated triplex DNA in E. coli cells as detected by chemical probing.. FEBS Letters. 1990, roč. 274, s. 39-42.

Studničková, M., Pitřincová, J., Kovář, J., Pečinka, P., Turánek, J. a Fischer, O. Metallotropic forms of zinc, copper and cadmium carbonic-anhydrases and zinc carboxypeptidase reflected in differential pulse polarography. . Bioelectrochemistry and Bioenergetics. 1989, roč. 22, s. 299-311.

Paleček, E., Brázda, V., Jagelská, E., Brázdová, M., Paleček, J., Pečinka, P., Karlovská, L., Cherny, D., Billová, S., Vojtěšek, B., Jovin, T. M. a Fojta, M. Binding of p53 protein to supercoiled DNA. In: Book of Abstracts. s. 9-.

Fojta, M., Cahová, K., Brázdilová, P., Pečinka, P., Fojtová, M. a Havran, L. Improved procedures for electrochemical detection of DNA hybridization with PCR-amplified target DNA?s. In: Book of Abstracts. s. Bio21-.

Pivoňková, H., Pečinka, P. a Fojta, M. Influence of cisplatin DNA modification on sequence-specific internations of p53 and p73 with different consensus sequence. .

Fojta, M., Pivoňková, H., Němcová, K., Šebest, P., Pečinka, P., Brázdová-Jagelská, E., Brázdová, M., Brázda, V. a Paleček, E. Interakce proteinu p53 s DNA: Sekvenčně specifická vazba a rozpoznání konformace DNA. In: Sborník příspěvků. s. 8-.

Brázda, V., Jagelská, E., Pečinka, P. a Paleček, E. Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies. In: Poster Abstracts. s. 95a-.

Jelen, F., Kouřilová, A., Pečinka, P., Kizek, R., Trnková, L. a Paleček, E. Stripping voltammetry of oligonucleotides. In: Book of Abstracts I.

Abbreviation	Subject
1BC1L	Biologie I. - cvičení
1BI1L	Biologie I.
2BC2L	Biologie II.
2BI2L	Biologie II.
BAKAP	Bakalářská práce
BAKPR	Bakalářská práce
BIOIN	Praktický kurz bioinformatiky
BI1LF	Biologie I.
BI2LF	Biologie II.
DIPPR	Diplomová práce
DIPPS	Diplomová práce
DIPRA	Diplomová práce
DIPR1	Příprava diplomové práce 1
DIPR2	Příprava diplomové práce 2
DIPSE	Příprava diplomové práce 2
DIPSS	Příprava diplomové práce 2
DPROT	Proteomika
GENZS	Obecná biologie
MEMOB	Vybrané metody molekulární biologie
MEMOL	Vybrané metody molekulární biologie
MOBIC	Molekulární biologie (praktika)
MOBIP	Molekulární biologie (přednáška)
MOBIS	Molekulární biologie
MOBIU	Molekulární biologie
MOLBI	Molekulární biologie
MOLBS	Molekulární biologie
MOLGE	Základy molekulární biologie a genetiky
OBEBC	Molekulární biologie a genetika - cv.
OBEBI	Obecná biologie
OBEBP	Molekulární biologie a genetika - př.
PBAKP	Příprava bakalářské práce II
PDIPS	Příprava diplomové práce 1
PDIP1	Příprava diplomové práce 1
POMBI	Pokročilé metody v molekulární biologii
PRBP2	Příprava bakalářské práce II
PRS01	Specializační seminář 1
PRS02	Specializační seminář 2
PRS03	Specializační seminář 3
PRS04	Specializační seminář 4
PRS05	Specializační seminář 5
PRS06	Specializační seminář 6
PRS07	Specializační seminář 7
PRS08	Specializační seminář 8
PRS09	Specializační seminář 9
PRS10	Specializační seminář 10
PRS11	Specializační seminář 11
PRS12	Specializační seminář 12
PZBP1	Příprava a zpracování bakalářské práce 1
PZBP2	Příprava a zpracování bakalářské práce 2
PZDP1	Příprava a zpracování diplomové práce 1
PZDP2	Příprava a zpracování diplomové práce 2
QCII1	Článek v index. imp. časopise 1
QCII2	Článek v index. imp. časopise 2
QCII3	Článek v index. imp. časopise 3
QCIN1	Článek v index. neimp. časopise 1
QCIN2	Článek v index. neimp. časopise 2
QCIN3	Článek v index. neimp. časopise 3
QELME	Elektromigrační metody
QMOSY	Molekulární systematika
QMVK1	Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 1
QMVK2	Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 2
QMVK3	Akt. účast na mezinár. vědecké konf. 3
QNVK1	Akt. účast na národní vědecké konf. 1
QNVK2	Akt. účast na národní vědecké konf. 2
QNVK3	Akt. účast na národní vědecké konf. 3
QSTNK	Struktura nukleových kyselin
QTOGE	Toxikologie a genotoxikologie
QVYC1	Výuková činnost 1
QVYC2	Výuková činnost 2
QZMVP	Zapojení do mezinárodního výzk. projektu
QZNVP	Zapojení do národního výzk. projektu
QZPD2	Zahraniční studijní pobyt dlouhodobý
QZSPD	Zahraniční studijní pobyt dlouhodobý
QZSPK	Zahraniční studijní pobyt krátkodobý
QZSPS	Zahraniční studijní pobyt střednědobý
STRNK	Struktura a funkce nukleových kyselin
SZMBB	Část SZZ: Molekulární Bi a biochemie
VMMOB	Vybrané metody molekulární biologie
WBINF	Bioinformatics
WMOBU	Molecular cell biology
WPMMB	Advanced course of molecular biology
WVMMB	Selected methods of molecular biology
XGENZ	Základy molekulární biologie a genetiky
XPBAK	Příprava bakalářské práce 2
YMOBI	Molekulární biologie
YOBBI	Obecná biologie
ZGENI	Základy genového inženýrství
6MBL2	Molecular Biology Laboratory II
6MOBU	Molekulární a buněčná biologie
7BAPR	Bakalářská práce
7DIPR	Diplomová práce
7MOBC	Molekulární biologie (cvičení)
7MOBM	Molekulární biologie (cvičení malé)
7MOBP	Molekulární biologie (přednáška)
7MOBU	Molekulární a buněčná biologie
7MOBV	Molekulární biologie (cvičení velké)
7PBP2	Příprava bakalářské práce 2
7PDP1	Příprava diplomové práce 1
7PDP2	Příprava diplomové práce 2
7PMMB	Pokročilé metody v molekulární biologii
7SDP1	Seminář k diplomové práci 1
7SDP2	Seminář k diplomové práci 2
7SEM1	Specializovaný diplomový seminář 1
7SEM2	Specializovaný diplomový seminář 2
7SEM3	Specializovaný diplomový seminář 3
7SEM4	Specializovaný diplomový seminář 4
7SFNK	Struktura a funkce NK
7VMMB	Vybrané metody molekulární biologie
7ZAGI	Základy genového inženýrství
DEMME	Elektromigrační metody
7SDP1	Seminář k diplomové práci 1
7SDP2	Seminář k diplomové práci 2
BI2LF	Biologie II.

Author	Title	Type of thesis	Year
Bažantová Pavla	Interactions of p53 protein family with non-B DNA structures	Doctoral thesis	2018
Poláčková Petra	Study of the c-myc gene structure in linear and supercoiled DNA	Master's thesis
Matějová Aneta	The optimalization of new high troughput method for the screening of potential G-quadruplex DNA sequences	Master's thesis	2019
Niziolová Anna	Thermostability of BRCA1-DNA complexes.	Master's thesis	2019
Vanduchová Veronika	In vitro characterization of selected human potential G-quadruplex loci	Master's thesis	2019
Kwaśný Ondřej	Binding of BRCA1 protein on local DNA structures.	Master's thesis	2018
Mikysková Nikol	Thermostability of p53-DNA complexes.	Master's thesis	2018
Kuchárová Zuzana	The study of protein BRCA1-DNA interactions.	Master's thesis	2017
Schillerová Sarah	The study of mutant p53 proteins interactions with DNA.	Master's thesis	2017
Wielgusová Kateřina	Influence of ions on the protein BRCA1-DNA interactions.	Master's thesis	2017
Brož David	The isolation and characterization of proteins involving in apoptosis.	Master's thesis	2016
Kopečková Monika	Making of recombinant plasmids for the study of DNA-protein interactions in vivo.	Master's thesis	2015
Podešvová Lucie	Making use of crosslinking for the analysis of DNA-protein interactions.	Master's thesis	2015
Staníčková Zuzana	Interaction of p73 protein with linear and supercoiled DNA.	Master's thesis	2015
Wozniaková Lucie	The influence of local structure DNA forming sequences on the replication of DNA plasmids.	Master's thesis	2015
Žihala David	Study of the DNA-protein interactions by means of footprinting	Master's thesis	2015
Chvátalová Barbora	The influence of naturally occuring sequence DNA on the interaction w?th p53 protein.	Master's thesis	2014
Drozdková Denisa	Gel electrophoresis as a tool for the detection of 3´- DNA ends prolonged by terminal deoxynucleotidyl transferase.	Master's thesis	2014
Bažantová Pavla	Interaction of p63 protein with p53CON in linear and supercoiled DNA.	Master's thesis	2012
Hodslavská Veronika	Mutation analysis of LDL receptor gene (LDLR) in familial hypercholesterolemia patients	Master's thesis	2012
Klemensová Eva	Detection of DNA damage by means of piperidine cleavage, reparation enzymes and/or PCR.	Master's thesis	2012
Kovácsová Andrea	Binding of tumor suppressor p53 to tetraplex DNA.	Master's thesis	2012
Moudrá Eva	Detection of DNA-damage caused by industrial dyes.	Master's thesis	2012
Podzimková Veronika	The study of apoptotic structural changes in DNA by means of gel electrophoresis.	Master's thesis	2012
Semer Jan	Using of PCR for the detection of dsDNA damage by osmium tetroxide complexes and diethylpyrocarbonate.	Master's thesis	2012
Boháčová Petra	Influence of genotoxic and mutagenic agents on the topological state of plasmid DNA	Master's thesis	2011
Hermanová Monika	Detection of local open strtuctures in natural p53-binding sequences by means of structural probes.	Master's thesis	2011
Široká Jana	Electrochemical detection of single-stranded tracts synthetized by means of terminal transferase in circle and linear DNA molecules.	Master's thesis	2011
Maršálková Karla	Sequence-specific binding of protein p53. Influence of ions	Master's thesis	2010
Dočkalová Zuzana	Study on genetic erosion risks during conservation process of genetic	Master's thesis	2009
Červeň Jiří	DETECTION OF MUTAGENICITY AND GENOTOXICITY BY MEANS OF CHANGES IN PLASMID DNA TOPOLOGY	Master's thesis	2008
Guziurová Simona	Proteins interacting wih DNA triplexes	Bachelor's thesis	2019
Palej Filip Roderik	DNA sequencing techniques	Bachelor's thesis	2019
Sluková Zdeňka	Mechanism of double-stranded breaks repair.	Bachelor's thesis	2018
Matějová Aneta	Influence of c-myc protein on the tumor formation.	Bachelor's thesis	2017
Vanduchová Veronika	Influence of pAPC protein on the tumor formation.	Bachelor's thesis	2017
Niziolová Anna	Binding of BRCA1 to damaged DNA. Interactions with proteins.	Bachelor's thesis	2016
Skýbová Tereza	Formation of epigenetics patterns during development of Drosophyla melanogaster.	Bachelor's thesis	2016
Ručková Romana	Detection of local structure DNA in vitro and in vivo.	Bachelor's thesis	2015
Wielgusová Kateřina	Influence of the tumour suppressor BRCA1 to repairing damaged DNA.	Bachelor's thesis	2015
Beinhauerová Martina	Structure and function of the tumour suppressor BRCA1.	Bachelor's thesis	2014
Beinhauerová Monika	Interaction of proteins of the 14-3-3 family with DNA.	Bachelor's thesis	2014
Kuchárová Zuzana	Structural changes in the regulation regions of protooncogenes and tumour suppressors.	Bachelor's thesis	2014
Kwaśný Ondřej	Interaction of IFI16 protein with DNAs and proteins.	Bachelor's thesis	2014
Schillerová Sarah	The influence of mutations in p53 gene on the tumour formation: changes in the binding preferences, the hot spots.	Bachelor's thesis	2014
Brož David	Analysis of interactions of p53 protein with sequences not containing p53CON.	Bachelor's thesis	2013
Kopečková Monika	Interactions of p53 protein with linear and supercoiled DNA not containing p53CON.	Bachelor's thesis	2013
Kortišová Lucie	Industrial dyes and their interaction with DNA.	Bachelor's thesis	2013
Podešvová Lucie	Structural analysis of naturally occuring DNA sequences interacting with tumor suppressor p53.	Bachelor's thesis	2013
Wozniaková Lucie	Influence of agents used in Ames test.on the topological state of plasmid DNA.	Bachelor's thesis	2013
Žihala David	Chromatine immunoprecipitation as a tool of the research of the interactions p53 with DNA.	Bachelor's thesis	2013
Bahounková Hana	Immunochemical methods used in the research of tumour suppressor p53.	Bachelor's thesis	2012
Chvátalová Barbora	Structural analysis of p53-binding sequence in supercoiled and linear DNA.	Bachelor's thesis	2012
Feber Kamil	Potential of usage of double-surface electrochemical methods in nucleic acids analysis.	Bachelor's thesis	2012
Holubová Aneta	Sequence-nonspecific interactions of protein p53 with DNA.	Bachelor's thesis	2012
Janečková Ema	Sequences forming G4-structures - properties, occurrence, their role in the gene expression.	Bachelor's thesis	2012
Königová Adéla	Detection of structural changes in the c-myc promotor by structural probes and polymerace chain reaction.	Bachelor's thesis	2011
Zbránková Veronika	Structure of homopurine.homopyrimidine sequences and their role at formation of genetic diseases.	Bachelor's thesis	2011
Bažantová Pavla	Binding of p63 protein to sequence-specific p53 (p53CON) binding sites.	Bachelor's thesis	2010
Ondráček Tomáš	Detection of DNA-cleavage by means of a piperidine and the polymerase chain reaction.	Bachelor's thesis	2010
Semer Jan	PCR optimization for the detection of DNA damage by means of osmium tetroxide complexes and diethylpyrocarbonate.	Bachelor's thesis	2010
Boháčová Petra	The comparison of genotoxic compounds behaviour in bacteria (in situ) and in vitro.	Bachelor's thesis	2009
Hermanová Monika	Structural characterization of naturally occurring binding sequences of p53 tumour suppressor	Bachelor's thesis	2009
Klemensová Eva	Detection of DNA damage by means of the polymerase chain reaction.	Bachelor's thesis	2009
Mičková Pavlína	Detection of mutagenic and potencial genotoxic chemicals by means of changes in plasmid DNA topology	Bachelor's thesis	2009
Moudrá Eva	Detection mutagenous and potential genotoxic compounds by repair enzymes	Bachelor's thesis	2009
Široká Jana	Detection of DNA damage by means of electrochemical methods.	Bachelor's thesis	2009
Urbanová Šárka	The preparation of recombinant plasmids containing p53CON binding sites. Characterization of p53-plasmid DNAs interactions.	Bachelor's thesis	2009
Kovácsová Andrea	The alkylation of DNA and methods of DNA-damage detection	Bachelor's thesis	2008
Maršálková Karla	Binding of a tumor suppressor p53 on open local structures in a superhelical DNA	Bachelor's thesis	2008
Šafarčíková Lucie	Sequence-specific and sequence-nonspecific binding of tumor suppressor p53 on scDNA	Bachelor's thesis	2008
Zumrová Kateřina	Utilization of electro-chemical methods for DNA-damage detection	Bachelor's thesis	2008
Dočkalová Zuzana	Research of genetic stability of selected pea (Pisum sativum L.) genotypes	Bachelor's thesis	2007
Dohnalová Táňa	Inactivation of FAD2 desaturase gene in flax (Linum usitatissimum L.) through the use of transgenic technology RNA interference	Bachelor's thesis	2007

Utilization of genomic and transcriptomic approaches to create genetic resources and breeding materials of poppy with specific traits
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2018 - 12/2022
Provider	Ministerstvo zemědělství
State	solved

Isolation and characterization of DNA-binding properties of BRCA1 protein.
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2016 - 12/2016
Provider	Specifický VŠ výzkum
State	finished

Structure and sequence specific DNA interactions of p53 protein family.
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2015 - 12/2015
Provider	Specifický VŠ výzkum
State	finished

Vliv iontů těžkých kovů na vazebné schopnosti proteinů rodiny p53
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2015 - 12/2015
Provider	Katedra biologie a ekologie, Projekty podporované z rozpočtu měst krajských úřadů
State	finished

Development of modern trends in experimental biology: importance of biomolecular interactions for functions of cellular structures
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	4/2012 - 3/2015
Provider	OP VK (Vzdělávání pro konkurenceschopnost)
State	finished

Characterization of binding properties of p53 protein family to structure and sequence specific DNA.
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2014 - 12/2014
Provider	Specifický VŠ výzkum
State	finished

Moderní biofyzikální metody: pokročilé praktické vzdělávání v experimentální biologii
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2010 - 12/2012
Provider	OP VK (Vzdělávání pro konkurenceschopnost)
State	finished

Tvorba předmětu "Pokročilé metody v molekulární biologii" pro studenty navazujícího studia Experimentální biologie
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2011 - 12/2011
Provider	Fond rozvoje vysokých škol
State	finished

Interactions of wild type and mutant p53 proteins with damaged DNA and their roles in cellular response to anticancer chemotherapy
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2007 - 12/2010
Provider	Standardní grantový projekt GA AV
State	finished

PřF 1074
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	9/2006 - 12/2009
Provider	Děkanát PřF
State	finished

Zkvalitnění laboratorních cvičení předmětu Vybrané metody molekulární biologie a zavedení nových praktických úloh
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2009 - 12/2009
Provider	Fond rozvoje vysokých škol
State	finished

Vybudování laboratoře molekulární biologie na Katedře biologie a ekologie Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity v Ostravě
Main solver	doc. RNDr. Petr Pečinka, CSc.
Period	1/2007 - 12/2007
Provider	Fond rozvoje vysokých škol
State	finished