| Identification of Distinct Amino Acid Composition of Human Cruciform Binding Proteins |
| Jiří Červeň, Petr Pečinka, Martin Bartas, Václav Brázda, Jack Liao, Pavla Bažantová ... other authors |
| Year: 2019, Molecular Biology |
journal article
|
| p53 Binds Preferentially to Non-B DNA Structures Formed by the Pyrimidine-Rich Strands of GAA center dot TTC Trinucleotide Repeats Associated with Friedreich's Ataxia |
| Robert Helma, Marek Petr, Matěj Adámik, Daniel Renciuk, Vlastimil Tichý, Alena Pastuchová, Zuzana Soldánová, Petr Pečinka, Richard Bowater, Miroslav Fojta, Marie Brázdová, Pavla BAŽANTOVÁ ... other authors |
| Year: 2019, Molecules |
journal article
|
| The Presence and Localization of G-Quadruplex Forming Sequences in the Domain of Bacteria |
| Martin Bartas, Michaela Čutová, Václav Brázda, Patrik Kaura, Jiří Šťastný, Jan Kolomazník, Jan Coufal, Pratik Goswami, Jiří Červeň, Petr Pečinka ... other authors |
| Year: 2019, Molecules |
journal article
|
| Bioinformatics analyses and in vitro evidence for five and six stacked G-quadruplex forming sequences |
| Martin Bartas, Václav Brázda, Václav Karlický, Jiří Červeň, Petr Pečinka |
| Year: 2018, BIOCHIMIE |
journal article
|
| Liver regeneration during the associating liver partition and portal vein ligation for staged hepatectomy procedure in Sus scrofa is positively modulated by stem cells |
| Martin Bartas, Jiří Červeň, Jan Oppelt, Matúš Peteja, Petr Vávra, Pavel Zonča, Václav Procházka, Václav Brázda, Petr Pečinka ... other authors |
| Year: 2018, Oncology letters |
journal article
|
| Preferential binding of p53 and BRCA1 proteins to naturally occurring G-quadruplexes forming sequences |
| Jiří Červeň, Nikol Mikysková, Anna Niziolová, Martin Bartas, Václav Brázda, Petr Pečinka ... other authors |
| Year: 2018 |
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
|
| Six-stacked G-quadruplexes as a preferential target of p53 |
| Martin Bartas, Nikol Mikysková, Václav Brázda, Václav Karlický, Jiří Červeň, Vladimír Špunda, Petr Pečinka ... other authors |
| Year: 2018 |
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
|
| The Amino Acid Composition of Quadruplex Binding Proteins Reveals a Shared Motif and Predicts New Potential Quadruplex Interactors |
| Václav Brázda, Jiří Červeň, Martin Bartas, Nikol Mikysková, Jan Coufal, Petr Pečinka ... other authors |
| Year: 2018, Molecules |
journal article
|
| Bioinformatic study of putative five and six stacked G-quadruplexes occurence in Homo sapiens genome |
| Martin Bartas, Václav Brázda, Jiří Červeň, Václav Karlický, Vladimír Špunda, Petr Pečinka ... other authors |
| Year: 2017 |
abstract in proceedings
|
| Antimutagenic and DNA Damage Protective Activities of a Grape Extract from Vitis vinifera |
| Jiří Červeň, Zuzana Rybková, Hana Sezimová, Petr Pečinka, Kateřina Malachová |
| Year: 2016 |
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
|
| Antimutagenic and DNA Damage Protective Activities of a Grape Extract from Vitis vinifera |
| Zuzana Rybková, Kateřina Malachová, Jiří Červeň, Hana Sezimová, Petr Pečinka |
| Year: 2016, Journal of Biosciences and Medicines |
journal article
|
| Isolation of bacterial and fungal BPA and TBBPA degraders from polluted soils |
| Jiří Červeň, Zuzana Rybková, Hana Sezimová, Kateřina Malachová, Petr Pečinka, Rong Ji ... other authors |
| Year: 2016 |
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
|
| Electrochemical Activity of Wedelolactone and Probing its Interaction with DNA Using Voltammetry at a Carbon Electrode |
| Jiří Červeň, Luďěk Havran, Petr Pečinka, Miroslav Fojta |
| Year: 2015, ELECTROANAL |
journal article
|
| Impact of cadmium, cobalt and nickel on sequence-specific DNA binding of p63 and p73 in vitro and in cells |
| Matěj Adámik, Pavla Bažantová, Lucie Navrátilová, Alena Polášková, Petr Pečinka, Lucie Holanová, Vlastimil Tichý, Marie Brázdová ... other authors |
| Year: 2015, BIOCHEM BIOPH RES CO |
journal article
|
| Effect of transition metals on sequencespecific binding of p53 family proteins |
| Pavla Bažantová, Jiří Červeň, Petr Pečinka, Matěj Adámik, Vlastimil Tichý, Marie Brázdová ... other authors |
| Year: 2014 |
abstract in proceedings
|
| Electrochemical approach for detection of p53-DNA interactions |
| Jiří Červeň, Petr Pečinka, Pavla Bažantová |
| Year: 2014 |
abstract in proceedings
|
| Kontaminace prostředí a změny na molekulárně genetické úrovni |
| Petr Pečinka, Jiří Červeň, Pavla Bažantová |
| Year: 2014, Ostravská univerzita v Ostravě |
specialist book chapter
|
| Studium dopadů průmyslových technologií na životní prostředí |
| Pavla Bažantová, Jiří Červeň, Aleš Dolný, Pavel Drozd, Zdeněk Ďuriš, Ivona Horká, Jiří Kalina, Václav Karlický, Petr Kočárek, Jana Kukutschová, Kateřina Malachová, Roman Maršálek, Zuzana Materová, Martin Mucha, Martin Navrátil, Zuzana Navrátilová, Jakub Nezval, Čeněk Novotný, Marie Opálková, Petr Pečinka, Vítězslav Plášek, Zuzana Rybková, Jan Semer, Hana Sezimová, Václav Slovák, Jan Ševčík, Vladimír Špunda, Jana Štefelová, Michal Štroch, Petra Veselá, Daniel Vrábl, Tomáš Zelenka ... other authors |
| Year: 2014, Ostravská univerzita v Ostravě |
specialist book
|
| Využití elektrochemických metod pro studium DNA-protein interakcí |
| Jiří Červeň, Petr Pečinka, Pavla Bažantová, Miroslav Fojta, Kateřina Malachová, Hana Sezimová ... other authors |
| Year: 2014 |
abstract in proceedings
|
| EMSA detection of p53 sequence non-specific binding in PCR produced human DNA analogues |
| Jiří Červeň, Petr Pečinka, Pavla Bažantová, Barbora Chvátalová, Marie Brázdová |
| Year: 2013, J BIOMOL STRUCT DYN |
journal article
|
| Preferential Binding of Hot Spot Mutant p53 Proteins to Supercoiled DNA In Vitro and in Cells |
| Petr Pečinka, Marie Brázdová, Lucie Navrátilová, Vlastimil Tichý, Kateřina Němcová, Matěj Lexa, Roman Hrstka, Matěj Adámik, Bořivoj Vojtěšek, Emil Palaček, Wolfgang Deppert, Miroslav Fojta ... other authors |
| Year: 2013, PLOS one |
journal article
|
| Investigation of sequence specific interaction of p63 and mutant p35-p63 interaction in vitro and in vivo |
| Petr Pečinka, Pavla Bažantová, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Marie Brázdová |
| Year: 2012 |
abstract in proceedings
|
| Selective binding of tumor suppressor p53 protein to topologically constrained DNA: Modulation by intercalative drugs |
| Petr Pečinka, Hana Pivoňková, P. Šebest, Olga Tichá, Kateřina Němcová, Marie Brázdová, Eva Brázdová-Jagelská, Václav Brázda, Miroslav Fojta ... other authors |
| Year: 2010, BIOCHEM BIOPH RES CO |
journal article
|
| Detection of genotoxicity by the means of DNA repair enzymes |
| Petr Pečinka, Petr Kočárek, Zuzana Pavlíčková, Vítězslav Plášek, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Šárka Cimalová ... other authors |
| Year: 2008, University of Ostrava |
specialist book chapter
|
| DNA topology influences p53 sequence-specific DNA binding through structural transitions within the target sites. |
| Eva Brázdová-Jagelská, Václav Brázda, Petr Pečinka, Emil Paleček, Miroslav Fojta |
| Year: 2008, BIOCHEM J |
journal article
|
| Oxidative damage of DNA induced in plasmid by the reactions with chemical agents |
| Zuzana Pavlíčková, Petr Kočárek, Petr Pečinka, Vítězslav Plášek, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Šárka Cimalová ... other authors |
| Year: 2008, University of Ostrava |
specialist book chapter
|
| Detection of genotoxicity of environmental contaminants using bacterial mutagenicity tests and by means of plasmid DNA |
| Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka |
| Year: 2007 |
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
|
| Detection of genotoxicity of chemical compounds using direct cleavage of sugar-phosphate backbone in supercoiled plasmid DNA |
| Zuzana Pavlíčková, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Petr Pečinka |
| Year: 2007 |
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
|
| Detection of genotoxicity of chemical compounds using direct cleavage of sugar-phosphate backbone in supercoiled plasmid DNA |
| Zuzana Pavlíčková, Jiří Červeň, Kateřina Malachová, Petr Pečinka |
| Year: 2007, Chemické zvesti |
journal article
|
| Inovace výběrových cvičení z mikrobiologie |
| Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka |
| Year: 2007 |
research reports and final reports of opposed grants
|
| Laboratorní cvičení z molekulární biologie |
| Petr Pečinka |
| Year: 2007 |
learning texts, university textbooks, tutorials, handbooks
|
| Obecná biologie |
| Kateřina Malachová, Petr Pečinka |
| Year: 2007 |
learning texts, university textbooks, tutorials, handbooks
|
| Recognition of negatively or positively supercoiled DNA topoisomers by the p53 protein. |
| Hana Pivoňková, Olga Tichá, Miroslav Fojta, Petr Pečinka |
| Year: 2007, FEBS J |
journal article
|
| Usage of DNA repair enzymes for detection of DNA base damage induced by mutagenic and genotoxic compounds |
| Jiří Červeň, Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka |
| Year: 2007, Chemické zvesti |
journal article
|
| Usage of DNA repair enzymes for detection of DNA base damage induced by mutagenic and genotoxic compounds |
| Jiří Červeň, Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka |
| Year: 2007 |
presentations (congresses, symposia, conferences, workshops)
|
| Vybudování laboratoře molekulární biologie na Katedře biologie a ekologie Přírodovědecké fakulty Ostravské univerzity v Ostravě |
| Petr Pečinka, Kateřina Malachová, Zuzana Pavlíčková |
| Year: 2007 |
research reports and final reports of opposed grants
|
| A single-surface electrochemical biosensor for the detection of DNA triplet repeat expansion. |
| Miroslav Fojta, Petra Brázdilová, Kateřina Cahová, Petr Pečinka |
| Year: 2006, ELECTROANALSIS |
journal article
|
| DNA modification with cisplatin affects sequence-specific DNA binding of p53 and p73 in the target site-dependent manner |
| Hana Pivoňková, Petr Pečinka, Pavla Češková, Miroslav Fojta |
| Year: 2006, FEBS Journal |
journal article
|
| Nové trendy v biologických oborech |
| Kateřina Malachová, Petr Pečinka, Petr Kočárek, Zdeněk Majkus |
| Year: 2006 |
learning texts, university textbooks, tutorials, handbooks
|
| Optimalizace postupů elektrochemické detekce amplifikovaných úseků genomové DNA s využitím molekulární hybridizace |
| Miroslav Fojta, Petra Brázdilová, Petr Pečinka, Kateřina Cahová, Miloslava Fojtová |
| Year: 2006 |
abstract in proceedings
|
| Ovlivnění interakce proteinů p53 a p73 s cílovými sekvencemi modifikací DNA cisplatinou |
| Hana Pivoňková, Petr Pečinka, Pavla Češková, Miroslav Fojta |
| Year: 2006 |
abstract in proceedings
|
| Sequence specific DNA binding of p53 can be enhanced by DNA supercoiling |
| Eva Brázdová-Jagelská, Václav Brázda, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: 2006 |
abstract in proceedings
|
| Využití elektrochemických metod při analýze genové exprese |
| Miloslava Fojtová, Petra Brázdilová, Petr Pečinka, Kateřina Cahová, Luděk Havran, Miroslav Fojta ... other authors |
| Year: 2006 |
abstract in proceedings
|
| Zkvalitnění a inovace výuky Cvičení z molekulární biologie |
| Zuzana Pavlíčková, Kateřina Malachová, Petr Pečinka |
| Year: 2006 |
research reports and final reports of opposed grants
|
| Male infanticide in captive plains zebra (Equus burchelli). |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Lenka Karlovská, Petr Pečinka, Šárka Pospíšilová, Bořivoj Vojtěšek, Emil Paleček ... other authors |
| Year: 2005, Animal Behaviour |
journal article
|
| Regulation of the DNA-binding ability of P53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies. |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: 2005, FEBS J |
journal article
|
| Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling |
| Emil Paleček, Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Marie Brázdová ... other authors |
| Year: 2004, ONCOGENE |
journal article
|
| Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercoiling. |
| Emil Paleček, Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Marie Brázdová ... other authors |
| Year: 2004, ONCOGENE |
journal article
|
| Enhancement of p53 sequence-specific binding by DNA supercolling |
| Eva Jagelská, Václav Brázda, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Emil Paleček |
| Year: 2004 |
abstract in proceedings
|
| Microanalysis of DNA by stripping transfer voltammetry. |
| František Jelen, Alena Kouřilová, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: 2004, BIOELECTROCHEMISTRY |
journal article
|
| New ELISA technique for analysis of p53 protein/DNA binding properties |
| Eva Jagelská, Václav Brázda, Petr Pečinka, Šárka Pospíšilová, Emil Paleček |
| Year: 2004 |
abstract in proceedings
|
| Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: 2004 |
abstract in proceedings
|
| Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by protein-kinase C, casein kinase II, cyclin dependent kinase and by monoclonal antibodies |
| Václav Brázda, Šárka Pospíšilová, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Bořivoj Vojtěšek, Emil Paleček ... other authors |
| Year: 2004 |
abstract in proceedings
|
| Aktivace vazby nádorového supresoru proteinu p53 k cílovým sekvencím superhelikální DNA |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Emil Paleček |
| Year: 2003 |
abstract in proceedings
|
| Analysis of p53 protein-DNA binding properties |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Lenka Karlovská, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: 2003 |
abstract in proceedings
|
| Analysis of tumour suppressor p53 protein binding properties by new ELISA technique |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Emil Paleček |
| Year: 2003 |
abstract in proceedings
|
| Binding of tumor suppressor protein p53 to supercoiled and chemically modified DNA |
| Miroslav Fojta, Václav Brázda, Hana Pivoňková, Marie Brázdová, Petr Pečinka, Emil Paleček, Jan Paleček ... other authors |
| Year: 2003 |
abstract in proceedings
|
| Microanalysis of DNA by stripping transfer voltammetry |
| František Jelen, René Kizek, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: 2003 |
abstract in proceedings
|
| Rozpoznání struktury DNA nádorově supresorovým proteinem p53. Úloha jeho C-terminální domény |
| Miroslav Fojta, Hana Pivoňková, Marie Brázdová, Petr Pečinka, Václav Brázda, Emil Paleček ... other authors |
| Year: 2003 |
abstract in proceedings
|
| Analysis of p53 protein-DNA binding properties by new ELISA technique, activation of p53-DNA binding |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Lenka Karlovská, Petr Pečinka, Šárka Pospíšilová, Bořivoj Vojtěšek, Emil Paleček ... other authors |
| Year: 2002 |
abstract in proceedings
|
| Regulation of p53 binding to natural binding elements in supercoiled DNAs by monoclonal antibodies |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Lenka Karlovská, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: 2002 |
abstract in proceedings
|
| Role of tumor suppressor p53 domains in supercoil-selective binding to DNA and p53-DNA filament formation |
| Marie Brázdová, Jan Paleček, Dmitrij Cherny, Sabina Billová, Petr Pečinka, Bořivoj Vojtěšek, Thomas M. Jovin, Emil Paleček, Miroslav Fojta ... other authors |
| Year: 2002 |
abstract in proceedings
|
| Role of tumor suppressor p53domains in selective binding to supercoiled DNA. |
| Marie Brázdová, Jan Paleček, Dmitrij Cherny, Sabina Billová, Miroslav Fojta, Petr Pečinka, Bořivoj Vojtěšek, Thomas M. Jovin, Emil Paleček ... other authors |
| Year: 2002, Nucleic Acids Research |
journal article
|
| Role proteinových domén nádorového supresoru p53 při selektivní vazbě na superhelikální DNA a při tvorbě DNA-proteinových filament |
| Marie Brázdová, Jan Paleček, Dmitrij Cherny, Sabina Billová, Petr Pečinka, Bořivoj Vojtěšek, Thomas M. Jovin, Emil Paleček, Miroslav Fojta ... other authors |
| Year: 2002 |
abstract in proceedings
|
| Effects of Oxidation Agents and Metal Ions on Binding of p53 to Supercoiled DNA. |
| Miroslav Fojta, Marie Brázdová, Hana Černocká, Petr Pečinka, Václav Brázda, Jan Paleček, Eva Jagelská, Bořivoj Vojtěšek, Šárka Pospíšilová, V. Subramaniam, Thomas M. Jovin, Emil Paleček ... other authors |
| Year: 2000, Journal of Biomolecular Structure & Dynamics |
journal article
|
| DNA tetraplex formation in the control region of c-myc. |
| Tomas Simonsson, Petr Pečinka, Mikael Kubista |
| Year: 1998, Nucleic Acids Research |
journal article
|
| studijní pobyt |
| Petr Pečinka |
| Year: 1996 |
work experience abroad
|
| . Chemical and electrochemical probing of local DNA structures and the role of DNA structures in cancer and genetic diseases |
| Emil Paleček, Miroslav Fojta, František Jelen, Petr Pečinka |
| Year: 1995, Physics, Chem. and applications of molecular systems Brno |
journal article
|
| Chemical Probing of DNA Structure in Cells: Osmium Tetroxide, 2,2´-Bipyridine. |
| Emil Paleček, Petr Pečinka |
| Year: 1995 |
abstract in proceedings
|
| Intramolecular TAT triplex in (dA)58.(dT)58. Influence of ions. |
| Petr Pečinka, Dori Huertas, Fernando Azorin, Emil Paleček |
| Year: 1995, Journal of Biomolecular Structure & Dynamics |
journal article
|
| Probing of DNA structure with osmium tetroxide complexes. |
| Emil Paleček, Petr Pečinka, Marie Vojtíšková, Jana Řičicová, Pavla Boublíková |
| Year: 1993, Collection Czech. Chem. Commun. |
journal article
|
| Osmium tetroxide complexes: single-strand selective probes of the DNA structure in vitro and in cells. |
| Emil Paleček, František Jelen, Karel Nejedlý, Jan Paleček, Petr Pečinka, Jana Řičicová, Marie Vojtíšková, Dagmar Zachová ... other authors |
| Year: 1992, Birghauser Verlag |
specialist book chapter
|
| výzkumný pobyt |
| Petr Pečinka |
| Year: 1992 |
work experience abroad
|
| Osmium tetroxide reactivity of DNA bases in nucleotide sequencing and probing of DNA structure. |
| František Jelen, Petr Karlovský, Eva Makaturová, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: 1991, General Physiology and Biophysics |
journal article
|
| Chemical proabing of the DNA polymorphic structure in vitro and in situ. |
| Emil Paleček, Pavla Boublíková, František Jelen, Alena Krejčová, Eva Makaturová, Karel Nejedlý, Petr Pečinka, Marie Vojtíšková ... other authors |
| Year: 1990, Adenine Press |
specialist book chapter
|
| Protonated triplex DNA in E. coli cells as detected by chemical probing. |
| Petr Karlovský, Petr Pečinka, Marie Vojtíšková, Eva Makaturová, Emil Paleček |
| Year: 1990, FEBS Letters |
journal article
|
| Metallotropic forms of zinc, copper and cadmium carbonic-anhydrases and zinc carboxypeptidase reflected in differential pulse polarography. |
| Marie Studničková, Jana Pitřincová, Jan Kovář, Petr Pečinka, Jaroslav Turánek, Oldřich Fischer ... other authors |
| Year: 1989, Bioelectrochemistry and Bioenergetics |
journal article
|
| Binding of p53 protein to supercoiled DNA |
| Emil Paleček, Václav Brázda, Eva Jagelská, Marie Brázdová, Jan Paleček, Petr Pečinka, Lenka Karlovská, Dmitrij Cherny, Sabina Billová, Bořivoj Vojtěšek, Thomas M. Jovin, Miroslav Fojta ... other authors |
| Year: |
abstract in proceedings
|
| Improved procedures for electrochemical detection of DNA hybridization with PCR-amplified target DNA?s |
| Miroslav Fojta, Kateřina Cahová, Petra Brázdilová, Petr Pečinka, Miloslava Fojtová, Luděk Havran ... other authors |
| Year: |
abstract in proceedings
|
| Influence of cisplatin DNA modification on sequence-specific internations of p53 and p73 with different consensus sequence. |
| Hana Pivoňková, Petr Pečinka, Miroslav Fojta |
| Year: |
abstract in proceedings
|
| Interakce proteinu p53 s DNA: Sekvenčně specifická vazba a rozpoznání konformace DNA |
| Miroslav Fojta, Hana Pivoňková, Kateřina Němcová, P. Šebest, Petr Pečinka, Eva Brázdová-Jagelská, Marie Brázdová, Václav Brázda, Emil Paleček ... other authors |
| Year: |
abstract in proceedings
|
| Regulation of the DNA binding ability of p53 protein by phosphorylation and by monoclonal antibodies |
| Václav Brázda, Eva Jagelská, Petr Pečinka, Emil Paleček |
| Year: |
abstract in proceedings
|
| Stripping voltammetry of oligonucleotides |
| František Jelen, Alena Kouřilová, Petr Pečinka, René Kizek, Libuše Trnková, Emil Paleček ... other authors |
| Year: |
abstract in proceedings
|
No record found.
